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日本人HLA領域SNPデータ
名称 日本人由来のEB-LCLに対するHLA領域8MbのSNPタイピングデータ
略称 日本人HLA領域SNPデータ
データ概要
・イルミナ1Mチップで取得したHLA領域の9,705ヶ所のSNPsデータです。
・HLA 6座位のタイピング結果が付属し、HLA対立遺伝子の名称は4桁表記です。
・ゲノム座標はhg18によります。
・QC前のデータです。
・全てのサンプルは連結不可能匿名化を行っています。
・タブ区切りテキストを圧縮したファイルで提供します。
サンプル数 92検体(連結不可能匿名化)
利用条件
このデータは「クリエイティブ・コモンズ 表示 - 非営利 4.0 国際」ライセンスの下に提供されています。
以下の論文の引用をお願いします。
参考文献 Kitajima H, Sonoda M, Yamamoto K. HLA and SNP haplotype mapping in the Japanese population. Genes Immun. 2012 Oct;13(7):543-548. doi:10.1038/gene.2012.35. PubMed
データ提供者
山本 健
久留米大学医学部医化学講座
〒830-0011 福岡県久留米市旭町67
TEL: 0942-31-7544
FAX: 0942-31-4377
Email: yamamoto_ken [at] med.kurume-u.ac.jp
公開サイト http://dbhla.jp/db_japsnp.html
最終更新日(調査日) 2015/3/4 (2015/3/4)
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